《表2 植物不同等级的染色质构型特征汇总》
作为基于概率模型分析染色质构型的主流技术,Hi-C和ChIA-PET已经被广泛应用在不同植物的染色质构型特征的鉴定、功能分析以及相互关系的研究中(表2)。按照目前业内广泛接受的标准(包含染色质区段大小的尺度和功能特征),植物染色质构型涵盖的等级主要包括:染色体(质)域(chromosome territory,CT)、A/B染色质区室(compartment A/B)、拓扑偶联结构域(topological associated domains,TADs)、染色质环(chromatin loops)以及IHIs/KEEs(interactive heterochromatic islands/KNOT EN-GAGED ELEMENTs)[5,16](图2)。接下来将从植物物种、材料性质、研究方法(Hi-C或ChIA-PET)、组成、建立机制或者主要的影响因素等方面,详细说明植物不同等级染色质构型的主要特征。
图表编号 | XD00126840500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.01.01 |
作者 | 董芊里、王金宾、李晓宠、宫磊 |
绘制单位 | 东北师范大学生命科学学院分子表观遗传学教育部重点实验室、东北师范大学生命科学学院分子表观遗传学教育部重点实验室、东北师范大学生命科学学院分子表观遗传学教育部重点实验室、东北师范大学生命科学学院分子表观遗传学教育部重点实验室 |
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