《表3 细菌在门水平群落结构》

《表3 细菌在门水平群落结构》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《应用Illumina Miseq测序分析川西高原传统牦牛发酵酸奶中细菌多样性》


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注:含量为<0.01代表含量极低,空白为未检出。

从表3细菌在门水平分布来看,8个样品共检测出8个细菌门,分别为硝化螺旋菌门(Nitrospirae)、Saccharibacteria、异常球菌-栖热菌门(DeinococcusThermus)、绿弯菌门(Chloroflexi)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)。所有样本均含有厚壁菌门,且含量占比高,占据总样本数量的98.33%~99.96%,这是因为牦牛酸奶中富含大量的乳酸菌,乳酸菌均为厚壁菌门,说明8份牦牛酸奶样品在属水平上群落结构多样性相近,优势菌门均为厚壁菌门。玛依乐·艾海提等[32]应用454焦磷酸测序技术对新疆阿图什及乌什传统发酵酸奶进行分析;智楠楠等[21]应用Illumina Miseq对市场上销售的酸奶进行分析;呼斯楞等[33]通过传统培养的方法对内蒙古地区酸奶进行了分析;以上实验得出的结果在门水平上均与本实验结果一致。硝化螺旋门主要是污水处理厂中的功能菌群[34],其仅存在于样品LV中,可能是牧民游牧时生活在污水处理厂附近,导致所采样品受到些许污染。放线菌门、变形菌门、拟杆菌门、硝化螺旋菌门和绿湾菌门均是植物土壤中常有的微生物菌门[35],牧民生活环境恶劣,常常以地为桌,做好的酸奶普遍放在地上,这可能是样品中均检测出少量这些微生物的原因。