《表4 山东栒子的前12个代谢途径》

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《山东栒子全长转录组测序数据组装及功能注释》


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KEGG数据库整合了基因组化学和系统功能信息,以揭示生命现象的遗传与化学蓝图(杨杰等,2000)。对山东栒子转录组的KEGG分析显示,一共有24 268个Unigenes被注释到KEGG数据库中,并分布在126个已知途径中。具有大量注释序列的前五个途径分别是碳代谢(ko01200,1313),氨基酸的生物合成(ko01230,1069),内质网中的蛋白质加工(ko04141,807),植物激素信号转导(ko04075,731),剪接体(ko03-040,729)。另一个重要途径包括RNA转运(ko03013,713),氧化磷酸化(ko00190,566),淀粉和蔗糖代谢(ko00500,561),m RNA监测途径(ko03015,549),核糖体(ko03010,530)。特别是植物-病原体相互作用途径,具有与植物抗性相关的功能,具有2.06%的注释高百分比。涉及山东栒子的基因注释最多的前12个代谢途径占所有KEGG途径的总量的33.95%(表4)。