《表2 龙眼HD-Zip基因家族受调控的miRNA预测》

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《龙眼HD-Zip基因家族生物信息及表达分析》

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为了预测各亚家族的miRNA种类，第2次搜索将期望值设置为E=4.0。当E=4.0时，我们发现龙眼HD-Zip家族主要还受到miR444b的调控，且调控的家族成员都是第Ⅳ亚家族的成员（DLHB4-5、DLHB4-6）；提示miR444b可能在该亚家族中有着重要的调控作用；同时我们发现，DLHB2-1受到了miR417的靶向调控；DLHB1-3受到了miR437c的靶向调控（表2）。在E=4.0的条件下，各亚家族成员虽都受到miRNA的调控，但不难发现龙眼HD-Zip第Ⅲ、Ⅳ亚家族的成员受到miRNA的调控较多。总的来说，不同亚家族受到调控的miRNA种类不同，但同一亚家族成员受到的调控虽较为一致但也有差异，可能是HD-Zip家族的各亚家族成员之间的结构与功能特异性所致。