《表4 茶树腋芽不同发育期碳氮代谢相关基因》
| 图表编号 | B16661000239666 |
|---|---|
| 出版时间 | 2019.07.30 图表说明 ➫ |
| 作者 | 吴琼、刘丹丹、阮旭、沈季雪、徐奕鼎、王文杰、张正竹、夏恩华 |
| 研究主题 | 茶树越冬芽萌展期碳氮代谢动态及相关基因分析 |
| 出版单位 | 安徽省农业科学院茶叶研究所、安徽农业大学省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室、安徽省农业科学院茶叶研究所、安徽省农业科学院茶叶研究所、安徽省农业科学院茶叶研究所、安徽省农业科学院茶叶研究所、安徽省农业科学院茶叶研究所、安徽农业大学省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室、安徽农业大学省部共建茶树生物学与资源利用国家重点实验室 |
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《表4 茶树腋芽不同发育期碳氮代谢相关基因》图表
注：热图中的颜色代表了基因在样品中的表达量水平，表达量水平以log2（FPKM+1）衡量，颜色从浅到深，表示基因表达量越高。
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茶树越冬芽萌展期碳氮代谢动态及相关基因分析中，我们分析了不同生育期腋芽的全转录组数据，数据质量报告见表3。通过比较各生育期的基因表达情况，一共筛选出961条差异表达基因（P<0.05）。将这些差异表达基因与拟南芥的基因组进行比对，在茶树基因组数据库（http://tpia.teaplant.org）上进行基因功能查询，结果发现有8个与碳氮代谢相关的基因表达差异显著（7个编码ATP酶家族基因：TEA005087、TEA006851、TEA014096、TEA016662、TEA016722、TEA025126、TEA029704，1个编码SPS酶基因：TEA030791）（表4）。在本研究中，我们发现基因TEA029704在休眠期时高表达，随着发育的进程，表达量逐渐降低。基因TEA029704与AT3G21180相似性高达93.103%，KEGG通路分析其为编码Ca2+-ATP酶的基因；TEA016722与TEA006851在休眠期低表达，在1芽1叶期高表达。基因TEA016722与AT2G34660相似性为59%，KEGG通路分析为编码热激蛋白基因；基因TEA006851随着发育的进程，表达逐渐降低，与AT3G12580相似性为93.739%，KEGG通路分析显示其为编码ATP依赖的蛋白水解酶基因。基因TEA030791与AT1G04920相似性达73.166%，KEGG通路分析显示其为编码蔗糖磷酸合成酶基因。
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