《理论物理与生命科学》

第1章概论1

§1.1 生物学走向21世纪1

§1.2 关于理论物理与理论生命科学的一些思考14

§1.3 复杂性与生命现象19

第2章蛋白质与生物大分子28

§2.1 蛋白质分子运动28

§2.2 蛋白质中的自折叠单元35

§2.3 分子模拟计算中的理论物理学问题40

§2.4 生物大分子结构的理论分析与模拟45

§2.5 生物分子的计算机模拟和结构、动力学、热力学61

§2.6 复杂生物体系的理论计算和药物设计69

§2.7 同源蛋白质三级结构的预测119

§2.8 蛋白质结构层次中的超二级结构148

第3章基因序列154

§3.1 DNA序列的几何学理论及其生物学意义154

§3.2 密码一序列一构象一动力学：一条可能的理论生物学路线169

§3.3 RNA结构的语言与代数拓扑特征174

§3.4 基因组序列的大尺度同源分析190

§3.5 符号序列的复杂性刻画200

第4章生物膜209

§4.1 膜蛋白209

§4.2 生物膜液晶模型215

§4.3 轴对称类脂双层膜泡形状方程223

第5章生物数学模型236

§5.1 免疫和肿瘤生长的非线性研究236

§5.2 心脑可激媒质非线性电动力学245

§5.3 分子马达——噪声驱动定向运动的一个模型257

附录267

生物凝聚态267

八十自述269

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