《表3 Fitvalue值排名前50的化合物及其Total Score值》

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《基于氧化苦参碱相似化合物的UQCRB抑制剂的虚拟筛选》


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氧化苦参碱与UQCRB上的活性位点对接的Total score为4.224,将对接成功的化合物的Total Score值与之作比较,高于氧化苦参碱Total Score值则表明该化合物与靶点蛋白之间的匹配度相对较高。统计筛选结果,其中Total Score大于氧化苦参碱Total Score化合物有34个,见表3。图5可以看出对接分数最高的1号分子与UQCRB的结合位于其活性位点的袋装腔内,对接分数为5.966,其氨基酸残基为Tyr21,ARG33、Tyr85、LEU122、LEU295和GLU91,与氧化苦参碱对接到UQCRB活性位点上的氨基酸残基基本一致,将34个分子与受体结合位点的氨基酸残基进行频率分析,排名前列的氨基酸为Tyr21,ARG33、Tyr85、GLU91,与氧化苦参碱的大致一致。