《表5 Xoc中国分离株内源质粒功能簇信息》

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《水稻条斑病菌内源质粒分析》


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“+”和“”分别表示根据PCR结果推测有或者没有对应的基因序列;(+)表示存在大小变异的基因

基于pXOCgx01质粒中含有的功能基因簇进行序列比对分析,结果显示在已完成测序的几个水稻黄单胞菌内源质粒中,这些基因簇的分布存在明显的多样性,值得对中国Xoc菌株内源质粒进行相关基因簇鉴定。根据pXOCgx01中3个基因簇的保守基因设计3对引物(表2),分别以分离的内源质粒为模板进行PCR扩增。电泳结果(图4)显示,只有pXOCB209质粒能扩增出3条条带;pXOCB116、pXOCB216和pXOCB220质粒中能扩增出tnp基因带;pXOC905和pXOCgx02质粒中能扩增出vir基因带;pXOC709中能扩增出1条明显小于预计产物的条带;pXOCB409和pXOC820中未扩增出任何条带。PCR扩增电泳结果提示p XOCB209质粒含有相应的3个基因簇(表5),pXOCB116、pXOCB216和pXOCB220质粒含有tnp基因簇,pXOC905和pXOCgx02质粒含有vir基因簇,pXOC709中可能含有变异的czc基因,而pXOCB409和pXOC820可能不含相关的3个基因簇,详细结果待完成序列测定。