《表1 SSR标记序列信息》

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《利用重测序InDel位点开发甜椒隐性核不育分子标记》

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根据2014年公布的辣椒参考基因组（Capsicum.annuum.L＿Zunla-1＿Release＿2.0 http://peppersequence.genomics.cn/page/species/download.jsp）作为参考，利用WGS全基因组重测序技术，对测序数据进行BSA性状定位分析，计算子代标记位点的Indel-index（即Indel频率）与△Indel-index（即两个子代Indel-index作差）。过滤掉两个子代池中小于0.3的点，挑选出子代池Indel-indel接近0或接近1的候选位点1 865个（McKenna et al.，2010）。对于候选位点提取ANNOVAR注释结果，优先挑选stop loss、stop gain、非同义突变或可变剪接的位点所在的基因位候选基因，筛选出可育基因与不育基因池的InDel差异候选位点共39个，候选基因27个。利用Blast对27个候选基因进行功能预测，经相关文献查找，最终敲定与甜椒核不育相关的候选基因16个，根据候选基因设计SSR引物8对（表1）。