《表1 不同产地萱草的ITS序列长度和GC含量》

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《秦岭南麓不同生境萱草ITS序列分析及遗传多样性研究》

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以22份不同产地萱草样本基因组为模板，利用ITS通用引物进行PCR扩增，发现了1条750 bp左右的明亮条带（图1）。通过测序并与GenBank公布的同属‘黑龙江萱草’、‘北黄花菜’、‘小黄花菜’的ITS序列比对（表1），25份样本的ITS序列总长度为598～608 bp，总GC含量为67%～71%。序列最短的为样本‘XC16’，最长的包含样本‘XC6’、‘XC9’、‘XC12’、‘XC19’、‘XC22’、‘XC24’及‘小黄花菜’。通过比对发现，供试样本材料的ITS序列中5.8 S rDNA编码区、18 S r RNA基因非编码区3'端、28 S rRNA基因非编码区5'端在不同材料之间有不同程度的变异。其中ITS1序列长度232～240 bp，GC含量70%～74%；5.8 S序列长度保守性高，均为162 bp，GC含量56%～59%；ITS2序列长度204～206 bp，GC含量69%～79%。比对结果还发现，序列长度的差异主要集中在ITS1区。