《表3 SNP统计分析：120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析》

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《120日龄文昌鸡RNA-Seq基因结构及SNP分析》

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通过TopHat软件查找各个样品潜在的SNP位点，并将所得SNP与鸡dbSNP数据库进行比对，区分可能发生在RNA和DNA水平上的SNP位点，然后注释。由表3、4可知，在WC-D120-B-1样品上得到45 242个可靠的SNP位点，其中转换型的33 675个，约占75%；WC-D120-B-3样品获得50 225个可靠的SNP位点，转换型和颠换型百分比分别为74%（37 263）和26%（13 767）。