《表2 分子描述符含义与方差膨胀因子》

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《有机化学品生物富集因子定量结构-活性关系模型》


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模型中描述符及各描述符的含义、种类与VIF值如表2所示,可知本模型包含7类描述符,分别是基本描述符、2D原子对描述符、3D-MoRSE描述符、分子连接性指数、基本指数、GETAWAY描述符、边界邻接指数。其中MLOGP2代表摩尔辛醇-水分配系数(Moriguchi-log KOW)的平方,Moriguchi模型是描述log KOW的方程[22]。F02[C-Cl]代表原子对“C-Cl”拓扑距离为2时出现的频率,nROH代表羟基的个数,P-117代表原子中心片段“X3-P=X”,Mor25m代表质量加权的散射函数,N%代表N原子的百分比,X4v是四价连接性指数,O-058代表原子中心片段“=O”,LLS_01是一个类药指数,H4v代表氢加权范德华体积滞后4的自相关函数,SM12_AEA(dm)代表增广边缘邻接矩阵的12阶谱距(加权偶极矩),O-057代表苯酚/烯醇/羧基中“OH”结构。仅选择MLOGP2构建模型,R2adj可达到0.676,说明辛醇水分配系数在构建生物富集因子模型时的重要性,这与其他作者观点一致[23-24]。化学物质的生物富集受化学物质本身的亲/疏水性、生物体类脂含量及代谢作用等影响,仅通过辛醇水分配系数往往不能充分表征生物富集的全过程,所以本模型中还包括其他类型的描述符,更加全面地描述大量化合物的相关结构。如:P-117代表分子中“X3-P=X”结构,“X3-P=X”结构是细胞膜磷脂结构中的疏水部分。nROH、O-057用于描述羟基、苯酚、烯醇、羧基中“OH”的结构信息,“OH”结构往往决定了化学物质本身的亲/疏水性。另外,模型中所有描述符的方差膨胀因子(VIF)均小于3,自变量与因变量组成的矩阵MYX的K相关指数KYX大于自变量矩阵MX的K相关指数KX,都表明描述符之间不存在严重的多重共线性。