《表2 5种致泻大肠埃希氏毒力基因的引物和探针序列》
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《5种致泻大肠埃希氏菌实时荧光定量PCR快速检测技术》
F为上游引物,R为下游引物,T为探针,FAM、ROX、JOE和CY5为荧光基团,BHQ1、BHQ2和BHQ3为淬灭基团。
肠道致病性大肠埃希氏菌(EPEC)的毒力基因为escV/eae、bfpB,产志贺毒素大肠杆菌(STEC)和肠道出血性大肠埃希氏菌(EHEC)的毒力基因为escV/eae、stx1、stx2A,产肠毒素大肠埃希氏菌(ETEC)的毒力基因为lt、stIa、stIb,肠道侵袭性大肠埃希氏菌(EIEC)的毒力基因为invE/ipaH,肠道聚集性大肠埃希氏菌(EAEC)的毒力基因为astA、aggR、pic(见表1);首先在NCBI中查找出escV、bfpB、stx1、stx2A、lt、stIa、stIb、invE、astA、aggR和pic的多个genebank序列号的基因序列,通过Genbank软件和BLAST软件进行序列同源性分析,确定各毒力基因的保守区域,采用Primer Premier 5.0和DNAstar软件在各自保守区域中设计引物与探针(见表2),将设计好的引物和探针委托生工生物工程(上海)股份有限公司进行人工合成。
图表编号 | XD0075103700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.01 |
作者 | 王芳妹、钟文涛、王淑好、卢琳、韩奉玲 |
绘制单位 | 湖南省产商品质量监督检验研究院、湖南师范大学生命科学学院、湖南师范大学蛋白质化学与发育生物学教育部重点实验室、湖南省产商品质量监督检验研究院、湖南省产商品质量监督检验研究院、湖南省产商品质量监督检验研究院、湖南省产商品质量监督检验研究院 |
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