《表3 花椒窄吉丁成虫触角样品转录组注释结果》
Blastp:蛋白序列比对蛋白库;Blastx:核酸序列比对蛋白库;GO:基因本体;KO:京都基因组百科全书;PFAM:蛋白家族;NR:NCBI蛋白数据库;NT:核酸序列数据库;Prot:蛋白质序列数据库;eggNOG:直系同源基因数据库
对花椒窄吉丁雌、雄成虫触角的总RNA进行分别提取、纯化后进行测序组装。测序得到的原始数据raw reads,再进行过滤获得clean reads(表1),并进行拼接与组装,获36 209 unigenes(表2)。花椒窄吉丁雌、雄成虫触角转录组GC含量为36.21%,Q30均大于90%,说明此次转录组数据可靠。对组装的unigenes进行基因注释,并对数据进行了统计(表3),统计结果发现雌、雄成虫触角转录组数据注释到NR数据库的基因数目最多,分别为20 750(39.47%)、23 149(41.93%),最后进行差异表达基因的筛选及富集分析等。
图表编号 | XD0071961400 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 巩雪芳、谢寿安、杨平、胡洪焰、郭莉、车显荣、陈迪、王延来、吕淑杰 |
绘制单位 | 西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院、西北农林科技大学林学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |