《表2 各样本聚类和去噪的结果及α多样性指数》
DD组样本由于条件极端未提取到DNA,其他7组23个样本经测序共获得1 300 684条有效序列,通过聚类和去噪及去除线粒体和叶绿体等特征后共获得968个OTUs和801个ASVs(表2)。比较发现,B、C、D区各组ASVs数明显高于OTUs数,表明酸矿水和沉积泥中具有较多序列相似性较高的16S rRNA基因,可能存在较多系统发生关系较近的物种,最近已研究采用去噪形成ASVs的方法分析酸性矿山排水中的微生物群落[30],因此本研究选择去噪的结果用于后续分析。
图表编号 | XD006814000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.25 |
作者 | 梁宗林、秦亚玲、王沛、王保军、刘征华、尹华群、刘双江、姜成英 |
绘制单位 | 中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室、中国科学院大学、中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室、中国科学院大学、中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室、中国科学院大学、中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室、中南大学资源加工与生物工程学院、中南大学教育部生物冶金重点实验室、中南大学资源加工与生物工程学院、中南大学教育部生物冶金重点实验室、中国科学院微生物研究所微生物资源前期开发国家重点实验室、中国科学院大学、中国科学院环境微生物技术联合实验室 |
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