《表1 绵羊肝脏、肺脏细粒棘球蚴原头节文库已知miRNA总数和发夹数》

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《绵羊肝脏、肺脏细粒棘球蚴原头节miRNA表达特征分析》

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注:miRBase，Sanger microRNA序列数据库；HPSC，肝脏原头节；LPSC，肺脏原头节

HPSC和LPSC文库中已知miRNA分别占17.9%（87/486）和16.5%（79/480）（图3） ，除miR-36a-3p、miR-36b-3p、miR-10229a-5p、miR-10233-5p、miR-10240-3p、miR-10243-5p、mir-10252-5p、mir-10287-5p等8条miNA在HPSC文库中极低表达外，其余miRNA在2个文库均表达且表达量一致（图4A）。HPSC文库中获得87条已知miRNA，其中有2条miRNA直接与细粒棘球绦虫miRNA数据库上的序列匹配，43条为由pre-mi RNA的5′端剪切而来的miRNA-5p，42条为由pre-mi RNA的3′端剪切而来的miRNA-3p。LPSC文库中获得79条已知miRNA，同样有2条miRNA直接与细粒棘球绦虫miRNA数据库上的序列匹配，37条为由前体的5′端剪切而来的miRNA-5p，40条为由前体miRNA 3′剪切而来的miRNA-3p。HPSC和LPSC文库中已知miRNA发夹结构匹配的pre-miRNA分别为52条和44条（表1），均分布于41个miRNA家族。这些miRNA家族具有保守性，其中let-7、miR-8、miR-10、miR-25和miR-133家族分别在75、68、76、73和69个物种中被发现。另外，HPSC和LPSC文库中与其他寄生虫（包括日本及曼氏血吸虫、扁虫及三代虫等）保守的miRNA分别占11.9%（58/486）和12.9%（62/480）。HPSC中特异表达的miRNA有sma-miR-745-3p、dqu-mir-133-5p、hme-miR-928、bmo-mir-2772a-2-3p、bmomiR-9a-5p、gsa-miR-67-3p、sja-miR-2a-3p、sjamiR-2162-3p；LPSC中特异表达的miRNA有ctemiR-29a、cte-miR-133、cte-miR-125、cbr-miR-239b、dps-miR-2527、lgi-miR-1、lgi-miR-10、lgimiR-375、bmo-miR-10-5p、bmo-mir-6497-5p、smemiR-31b-5p、dpe-miR-133（图4）。