《表1 GenBank已发表序列信息》

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《猪线粒体控制区微卫星(mtMs)变异及其分布特征》

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通过对GenBank（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/）中地方猪种、选育猪种和野猪210个个体的mtDNA D-loop区比对分析，表明核苷酸序列长度存在较大程度差异，介于1 064 bp（AY879772，韩国地方猪）和1 505 bp（EU117375，西班牙野猪）之间，造成这种差异的原因在于D-loop中重复单元“5'-TGC GTACACG-3'”重复次数不同（表1）。为进一步分析结构特征，对中国4个藏猪群体、八眉猪、烟台黑猪及引入猪种杜洛克、大白和长白猪164个个体mtDNA D-loop核苷酸序列进行了分析，结果表明，“5'-TGCG TACACG-3'”并不是唯一的微卫星片段，存在多个变异形式，进而形成了复合mtMs结构。分析发现，“5'-TGCGTACACG-3'”（RA）是mtMs重复单元的核心序列，其中第2位、第4位和第10位上的“G”突变为“A”和第3位“C”突变为“T”而产生了相应的变异序列（RA-RG）（表2） 。长度分析表明：mtDNA D-loop序列碱基长度差异数在10的倍数水平。序列比对结果显示，mtMs区域最短片段为30 bp，最长470 bp，均因重复单元重复次数差异而产生，即个体间mtMs的重复单元数介于3～47之间。有64.44%（241）的个体mtMs区域是由核心序列RA的组成的单一重复（重复次数3～47），而35.56%（133）的个体是由核心序列及其变异结构相互交错组成的复合mtMs结构（重复次数7～30）。