《表3 常用的生物信息学平台及其主要工具》

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《酱油酿造过程中微生物多样性分析方法研究进展》

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宏基因组学的分析方法主要是基于高通量测序技术和数据处理分析平台对扩增子测序和全基因组测序结果进行分析。其中，以对16SrDNA扩增进行测序分析的方法最常用[56]。表3列举了宏基因组学研究中部分常用的生物信息学平台。通过数据处理分析平台可以对序列进行前处理和分析，包括序列去噪、质量控制、序列拼接、分类学分析和序列功能预测等，进而分析微生物群落组成、群落功能、遗传多样性、微生物代谢的相互作用及其与环境因素的相互关联等[57-59]。