《表3 DAVID和Gene Codis KEGGpathway分析交集》

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《乳腺癌组织中PROX1的表达和临床病理参数之间的相关性及其共表达基因分析》

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为了进一步探寻PROX1基因的功能，本研究使用了Ocomine数据库中的所有乳腺癌组织样本作为研究对象，分析与其共表达的基因并利用生物信息学工具预测其可能的功能。首先本研究从Ocomine数据库中检索出可供分析的11个乳腺癌临床样本数据集，然后选取了相关性在0.4以上的466个基因进行后续分析。本研究分别使用DAVID GeneCodis对上述466个基因进行基因注释，计算得到的结果以P<0.05为阈值，筛选满足条件的GOterm然后取交集，其中在生物学过程（BP）方面两者交集的GO条目共有8个，在细胞组成（CC）方面两者交集的GO条目共有14个，在分子功能（MF）方面两者交集的GO条目共有10个。本研究分别使用DAVID和GeneCodis对上述466个基因进行KEGG分析。计算得到的结果以P<0.05为阈值，筛选满足条件的KEGGterm，然后取交集，两者KEGGpathway分析的交集共有10个条目，具体条目内容见表3。