《表1 ORA分析ITE处理后U87MG和GL261间相同的GO富集的交集》
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《整合mRNA-miRNA转录组比较ITE对人鼠胶质瘤细胞作用的异同》
本研究使用DAVID和CPDB两种分析工具中进行了差异基因的通路和GO的ORA分析,以p<0.05统计结果。发现U87MG和GL261间差异表达的基因没有富集到相同的通路上(图3),GO富集到的结果也不同(表1),与wilcoxon富集分析得到的结果差异较大。由ORA分析获得的CDK4/PRMT5表达差异在Real-Time PCR中的验证及wilcoxon-GO富集了的已知AHR的重要功能,提示我们不同分析方式产生的结果提供了互补的信息,在分析转录组数据时应采用多种分析方式全面分析转录组。
图表编号 | XD00196501800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.25 |
作者 | 舒秋婷、赵丽娇、马云龙、姜萱璟、巩培、鲁静、万方 |
绘制单位 | 内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古农业大学生命科学学院、内蒙古农业大学生命科学学院 |
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