《表3 过滤后读数质量统计》
注:Q20和Q30分别为过滤后读数中质量值大于20和30的碱基数占总碱基数的百分比。
原始数据中包含低质量读数等成分(表2),将其过滤后对照与处理组分别得到过滤后读数44.93Mb、45.36 Mb,Q20分别为98.71%、98.81%(表3)。过滤后读数经组装后的转录本进行去冗余得到单基因,对照与处理组分别获得61 038、76 345个单基因,平均长度分别为898、834 bp,N50值分别为1 468、1 391,GC碱基比例分别为51.69%、51.73%(表4),测序数据质量较高,符合进一步进行生物信息学分析的要求。
图表编号 | XD0060300100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 宋士伟、焦德志、陈旭、赵泽龙、杨允菲 |
绘制单位 | 齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室、齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室、齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室、齐齐哈尔大学生命科学与农林学院抗性基因工程与寒地生物多样性保护黑龙江省重点实验室、东北师范大学草地科学研究所植被生态科学教育部重点实验室 |
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