《表1 过滤后序列质量分析》

《表1 过滤后序列质量分析》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于RNA-Seq技术的茶树响应高温胁迫转录组差异性分析》


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注:Q20,Q30:表示质量值大于20,30的碱基数目占总碱基数目的比例;A:原始序列数据;B:过滤后测试数据

Illumina Hiseq平台一共测序获得53.7 Gb数据,去除原始数据中低质量、接头污染以及未知碱基N含量过高的Reads后获得Clean reads;各样本得到的Clean reads与原始Reads的比例均在82%以上,Q20和Q30分别达到了98%和96%以上(表1),证明测序的建库工作质量和数据良好;数据经Trinity组装拼接后,各样本获得的转录本均超过95 044条,总长度均超过67 081 941 nt,平均长度均超过662 nt,N50长度均超过568 bp(表2);各样本Unigene均超过60 976条,总长度,平均长度,N50以及GC含量分别大于53 974 945 nt,840 nt,1 411 bp和41.36%,组装所得片段有很好的完整性,拼接所得序列较长,测序效果良好,可用于后续分析。