《表1 过滤前后的reads质量统计表》

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《镉胁迫后旱柳转录组变化分析》

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9个样品的raw reads数在72.22 Mb到85.59 Mb之间，过滤后的总clean reads在65.17 Mb到67.15 Mb之间；Q20、Q30以及过滤前后的reads的比率分别为95.04%到97.38%，86.40%到90.91%，72.75%到89.4%（表1），这说明低质量的碱基比率低，测序质量好，可以用于下一步的de novo组装。使用Trinity对其进行组装，所有样品的总reads数均超过10万，总长度超过7 000万，平均长度超过600，N50超过1 000，GC含量42%左右。接下来使用Tgicl对转录本进行聚类去冗余得到Unigene，聚类后的Unigene质量见表2，10个样品的Unigene数为53 705个到62 933个，总长度从43 247 382 nt到50 853 969 nt，N50值都在1 200之上，这表明组装质量高，可用于后续分析。