《表2 经注释的小RNA数量》

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《月季‘绿萼’花器官发育相关microRNA的鉴定及分析》


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本研究从‘绿萼’和‘月月粉’序列的有效片段中,筛选出长度为18~30 nt的miRNA进行后续分析。2种月季中,miRNA长度范围主要集中在21~24 nt,其中24 nt的miRNA数量最多(图2),约占49.15%。以2种月季相应组织的转录组数据为参考序列,将长度适合的miRNA定位到参考序列,分析小RNA(sRNA)在其中的分布情况。结果显示,‘绿萼’匹配到的参考序列有12 431 895条,‘月月粉’有12 676 976条。对所有microRNA与各类RNA序列进行比对,注释情况按照检测的优先级进行总结,依次排序为:已知miRNA>核糖体RNA>转运RNA>细胞内有小核RNA>核仁小RNA>重复相关小RNA>新miRNA>反式作用干扰小RNA(表2)。