《表3 番茄3种病原细菌反向斑点杂交探针》

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《基于锁式探针技术的番茄病原细菌DNA芯片快速检测技术》

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根据DREIER等[22]、FANELLI等[23]和LEE等[24]分别获得的番茄溃疡病原菌、番茄斑点病原菌、番茄青枯病原菌的一段特异性片段，通过Blast可以与其近似种进行比对，在其碱基差异较大的地方找出一段序列作为T1、T2区，根据锁式探针设计原则[25]，采用软件Oligo和DNASTAR分别设计锁式探针。设计的锁式探针两端检测臂T1、T2分别和Cmm、Pst、Rs1的特异性片段碱基序列互补，锁式探针中间的一段连接区域采用小鼠基因xist(NCBI Reference Sequence:R＿001463.3）一段序列，设计好的锁式探针、通用扩增引物（见表2）均由上海生物工程有限公司合成，锁式探针合成时对其5′端进行磷酸化修饰。杂交探针（见表3）合成时3’端加氨基修饰。