《表1 GO显著富集代谢通路》

《表1 GO显著富集代谢通路》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《低温条件下蓖麻种子萌发期转录组分析》


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GO富集分类结果(图1)显示,953个DEGs被注释到GO功能三大类的54个亚类中。其中,生物学过程有19个亚类共664个DEGs,细胞组分有16个亚类共245个DEGs,分子功能有19个亚类共843个DEGs。在生物学过程这一类中,DEGs在生物合成过程、细胞蛋白质修饰过程、细胞氮复合物代谢过程和碳水化合物代谢过程四个功能亚类中所占比例分别为19.13%、17.32%、11.30%和9.79%。在细胞组分这一类中,DEGs在蛋白复合体、细胞核和细胞骨架三个功能亚类中所占比例较高,分别达到了21.63%、17.55%和11.84%。而在分子功能这一类中,DEGs主要涉及离子结合、氧化还原酶活性和激酶活性等功能。对GO富集分类进一步分析显示,相对于适温处理组,低温处理组表达上调的DEGs被富集到60个GO term中,涉及216个DEGs,其中显著富集的GO term有6个,共69个DEGs参与,在微管驱动活性、驱动蛋白复合物、微管运动、微管结合、DNA复制和细胞核功能中有显著富集;下调的DEGs被富集到40个GO term中,共113个基因,其中显著富集的GO term有4个,共17个DEGs参与,在细胞葡萄糖代谢过程、木葡聚糖转移酶活性、质外体和丝氨酸/苏氨酸磷酸酶活性功能中有显著富集(表1),暗示这些功能的DEGs在蓖麻低温萌发过程中发挥重要作用。