《表1 Cox回归分析中筛选的差异lncRNA Tab 1 Differentially expressed lncRNAs screened from Cox regression analysis

《表1 Cox回归分析中筛选的差异lncRNA Tab 1 Differentially expressed lncRNAs screened from Cox regression analysis   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《TCGA数据库中肝癌相关差异长链非编码RNA筛选和功能预测》


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为了寻找在肝癌中重要的lncRNA,我们通过miRcode数据库筛选和差异表达的miRNA相关的lncRNA 77个,对77个lncRNA进行Cox多因素生存分析,设置P<0.01为筛选标准,最终发现与肝癌预后相关的6个lncRNA组合(见表1、图3),其中高表达的有5个,与肝癌的生存期呈正相关;低表达的有1个,与肝癌的生存期呈负相关。与77个差异lncRNA相关的差异miRNA有16个,通过三个数据库(miRDB、miRTarBase、TargetScan)预测得到的靶mRNA和差异表达的mRNA取交集,最终获得与肝癌有关的mRNA有35个;同样设置P<0.01为筛选标准,对16个miRNA和35个mRNA做Cox多因素生存分析,发现与肝癌生存相关的miRNA有1个(见表2、图4),mRNA有20个(见表3、图5)。