《表2 单因素Cox回归分析初步筛选和膀胱癌预后相关的lncRNA》

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《基于长链非编码RNA的生物信息学分析构建膀胱癌预后模型并确定预后生物标志物》

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首先我们汇总了TCGA数据库409例膀胱移形细胞癌患者的临床基线资料表（表1）；其次，利用“edgeR”包，通过对比19例癌旁或正常膀胱组织和414例膀胱癌组织（来源于409例患者，其中5例组织属于重复取材）的lncRNA表达情况，根据筛选标准FDR<0.05且|log2（fold change）|>2，共有691个lncRNA被确认为差异表达的lncRNA，其中包括337个表达上调的lncRNA和354个表达下调的lncRNA（图1A）。针对这些差异表达的lncRNA，结合TCGA来源的相应临床信息，通过单因素Cox回归分析，初步筛选出35个和膀胱癌预后相关的lncRNA（表2），并通过Lasso回归分析进一步确定了23个关键的lncRNA（图1B、C）。另外，初步筛选的35个lncRNA的表达水平用热图展示（图2）。