《表3 差异表达的部分基因的功能分析Tab.3 Functional analysis of differentially expressed genes》

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《转录组分析组蛋白去乙酰化酶抑制剂TSA对毛白杨悬浮细胞表达谱的影响》


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组蛋白乙酰化酶可通过与转录因子相互作用来共同调控靶基因的转录。有研究报道,拟南芥组蛋白去乙酰化酶HDA6与AS1协同调控叶形态,HDA6与AS1直接互作,在hda6/as1双突变体中,表现出了比as1更明显的叶形态发育异常表型[11]。分析结果表明:差异表达显著且数量较多的转录因子家族有AP2/EREBP、NAC、WRKY、MYB、Zinc finger、b HLH和Gata等(表3)。ERF、MYB、NAV、WRKY、b HLH等转录因子在植物发育生长、激素信号转导通路调控上起着关键作用,TSA的添加导致信号传导途径相关的基因出现异常。如植物生长素IAA家族有5个转录因子的下调,包括IAA8等;MYB转录因子家族有15个下调,其中包括对木质素合成基因的表达进行正调控MYB85、MYB101等。上调转录因子中,MYB家族有11个,包括MYB87、MYB59和调控黄酮生物合成的MYB29;WRKY家族有11个转录因子上调,包括参与盐胁迫WRKY41等。说明经过TSA处理,抑制HDAC的活性,导致染色质结构发生改变,影响了转录因子的表达。