《表1 基于COI (左下) 和Cytb (右上) 基因的沙塘鳢科鱼类种间和种内遗传距离》

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《沙塘鳢科鱼类的DNA条形码及分子系统学研究》

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从GenBank中下载沙塘鳢科鱼类各属部分物种（表1）的COI基因序列24条，联合本研究获得的5条序列，另将1条圆鳞发光鲷（Acropoma hanedai）（GenBank登录号:DQ648436） 的COI基因序列作为外群构建系统发育树，共计30条。同样地，本研究中用于分析的Cytb基因序列共28条，包括本研究获得的5条序列和其他的沙塘鳢科鱼类Cytb基因序列22条，另将1条须软鱼（Malakichthys barbatus）Cytb基因序列（GenBank登录号:AB104914）作为外群。通过Clustal W程序按照缺省参数进行序列多重比对[27]。所选序列进行两两之间的K2P遗传距离的计算，计算由MEGA完成[28]。利用在线软件The CIPRES Science Gateway V.3.1（http://www.phylo.org/sub＿sections/portal/）构建Maximum-likelihood（ML）树，选用模式为RAxML-HPC2XSEDE（8.2.10）[29-31]。Bayes（BI）树在MrBayes 3.1.2软件中构建，位点变异设置为invgamma分布，序列最佳进化模型为GTR+I+G，运行1 000 000代[32]。最后用FigTree v1.4.2和Photoshop CS3两款软件完成系统树的绘制。