《表3 中性检验相关参数:玉米抗圆斑病基因ZmHM1的序列变异分析》

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《玉米抗圆斑病基因ZmHM1的序列变异分析》


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θ和π是核苷酸多态性分析过程中的常用参数,其中π被用来衡量同一位点不同序列两两之间的差异;而群体突变率则是用θ来衡量。在本研究的62份常用自交系中,ZmHM1基因全长序列(含启动子区段)的π值为0.012 3,θ值为0.010 9。在中性进化的条件下,π和θ的值近似相等。通过比较π和θ的差异,Tajima’s D测验用于检验选择效应。对ZmHM1基因序列中的多态性位点,进行Tajima’s D测验,结果显示全长序列的Tajima’s D没有达到显著水平,说明整段序列没有经过选择作用。