《表2 分子对接结果Tab 2 The results of molecular docking》

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《计算机模拟研究肝素联合川芎嗪的协同抗血栓药理机制》

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从PDB数据库中获取1F0R、1RFN、2B7A、1Z6J、2ANY、1A7C6个带有原配体的蛋白质结晶，利用PyMOL软件剥离原配体后，再用AutoDock vina进行分子对接验证。（1）图5～10中A为靶蛋白与原配体正向对接模型，B为靶蛋白与川芎嗪正向对接模型，C为靶蛋白与川芎嗪反向对接模型。由图5～10A可见，6个靶蛋白的原配体在分子对接前后位置高度重叠，准确性良好。（2）将川芎嗪用AutoDock vina进行分子对接，活性口袋位置、大小均设置为与原配体相同。由图5～10B和图5～10C及表2～3可见，川芎嗪正反分子对接的结合位点与原配体一致，且靶蛋白与原配体、川芎嗪结合的4A°以内的氨基酸残基基本一致，由于原配体位于6个靶蛋白的活性抑制位点上，具有抗栓作用[18-23]，说明川芎嗪与各靶蛋白的结合也是在活性抑制位点上，故推测其能抑制各靶蛋白的活性，产生类似的抗栓作用。表2为原配体、川芎嗪与靶蛋白的亲和力。