《表1 各染色体多态性标记分布》

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《东乡野生稻与日本晴多态性标记的开发》


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为了获得更多的多态性标记,对东乡野生稻进行了基因组重测序,通过与对照基因组比对,分别在染色体基因上游、外显子、内含子和基因下游区共检测到373,501个InDel。根据此结果,设计了217对InDel标记引物,经过检测,其中122个标记显示出多态性,多态率为56%(图1)。综合以前和本次设计的引物,共获得203个东乡野生稻与日本晴间有多态的分子标记。每条染色体上分子标记数目为9~30个,平均间隔为1.2~2.6 Mb(表1和附表1)。