《表1 牡蛎样品平均Tm值》

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《食品过敏原牡蛎成分PCR检测方法的初步研究》


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本实验分别对所收集样品进行SYBR Green I实时荧光PCR检测,获得了S型扩增曲线,得到PCR仪分析出的从基线到指数增长的拐点所对应的循环次数Ct值,结合熔解曲线与其对应的熔解温度(Tm)分析得到的特征峰(见图5),平均Tm值通过对各个样品收集数据计算出为80.08℃平均Ct值为19.40(见表1),所有牡蛎样品的Ct值和Tm值与阳性对照相符,由此通过基于SYBR Green I的熔解曲线分析荧光PCR方法可以快速的检测牡蛎成分。在实验过程中初步退火温度选择为60℃时,阴性样品中蛤蜊样品与扇贝样品出现了非特异性扩增。在进一步的实验中,分别选择61~68℃作为退火温度进行实验,当退火温度为63℃时,蛤蜊的Ct值在35左右,扇贝的Ct值在38左右,从熔解曲线分析可知牡蛎样品的特征峰值更高,而蛤蜊、扇贝等样品的特征峰偏低并且Tm值较牡蛎低。随着退火温度的升高(61~64℃)蛤蜊、扇贝样品的Ct值、Tm值下降但仍存在一部分非特异性扩增的情况,当退火温度提升至65℃时,基本能消除非特异性扩增,阴性样品均无S型扩增曲线出现,并且无特征峰和相应的Tm值(见图6),而退火温度提升至68℃时,虽然非特异性扩增被完全消除,但阳性样品的扩增也会受到一定抑制(见表2)。