《表2 基因表达数据集Tab.2 Gene expression dataset》
本研究选用白血病、结肠癌和前列腺疾病3个基因表达数据集[15],数据集具体信息如表2所示。其中Colon数据集为结肠癌数据集,正类为结肠癌样本,负类为正常组织样本。Leukemia数据集为白血病数据集,正类为急性淋巴细胞白血病(acute lymyhoblastic leubemia,ALL)样本,负类为急性髓性白血病(acute lymyhoblastic leubemia,AML)样本。Prostate数据集为前列腺疾病数据集,正类为前列腺样本,负类为正常组织样本。基因表达数据为数值型数据,列为样本,行为基因。以Colon数据集为例,是一个62列2 000行矩阵形式的数据集。为了评价特征子集的分类预测性能,使用支持向量机(support vector machine,SVM)作为分类器进行测试。在实验过程中,支持向量机的核函数选用线性核。为预防过拟合现象和人为因素的影响,对数据集进行五折交叉验证实验。
图表编号 | XD0040104400 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.02.01 |
作者 | 杜冲、周长银、李悦、李潇宁 |
绘制单位 | 山东科技大学数学与系统科学学院、山东科技大学数学与系统科学学院、山东科技大学数学与系统科学学院、山东科技大学数学与系统科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |
查看“表2 基因表达数据集Tab.2 Gene expression dataset”的人还看了
- 表2 每组中ACs、cAMP及PKAs的mRNA相对表达量 (, n=10) Tab.2 Gene expressive changes of thoracic aorta related to function in each group
- 表5 各组大鼠胃黏膜COX-1、COX-2基因表达比较 (±s) Tab.5 Comparison of expression of COX-1 and COX-2 gene in gastric mucosa of each group