《表1 本研究的参考菌株:西双版纳5种附生兰非菌根内生真菌多样性研究》
参考真菌DNA快速提取法(Chi et al.2009),用研磨仪(上海净信实业发展有限公司,JXFSTPRP-24)60Hz研磨120s,快速提取内生真菌的DNA。采用引物对ITS-1(5’-TCCGTAGGTGAAC CTGCGG-3’)和ITS-4(5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’)(White et al.1990)扩增核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacers and 5.8S rDNA,ITS),PCR扩增产物由杭州擎科梓熙生物技术有限公司用ABI 3730测序仪进行测序。采用BLAST(Altschul et al.1990)进行基本序列比对,MAFFT(Katoh&Standley 2013)将ITS1-5.8S-ITS2rDNA序列与已知的代表性序列(表1)进行多重序列比对,gblocks(Dereeper et al.2010)选择序列保守区,采用最大似然法(maximum likelihood,ML)用软件IQTREE(Trifinopoulos et al.2016)建立系统发育树。
图表编号 | XD003981600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.22 |
作者 | 冯晓晓、陈家杰、刘峰、胡卫珍、林福呈、章初龙 |
绘制单位 | 浙江大学生物技术研究所、浙江大学农业试验站、浙江大学生物技术研究所、纳板河国家级自然保护区管理局、浙江大学农业试验站、浙江大学生物技术研究所、浙江大学生物技术研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |