《表2 广藿香ITS2序列变异位点信息Tab.2 ITS2 sequences variation sites information of P.cablin》

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《DNA条形码及ISSR技术对广藿香种质资源的分析》


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通过对比16个广藿香样品的ITS2序列,结果显示SJ1、SJ2、SJ3、TS3、ZQ1、ZQ2、ZQ3、ZQ5、ZJ2、ZJ3、ZJ4、ZJ5这12条序列完全相同,TS1、TS2和ZQ4这3条序列均有1个碱基的差异,ZJ1序列有3个碱基的差异。经CLUSTALX 1.81和MEGA6.06软件排序分析,16个广藿香样品的序列长度均为345 bp,存在6个变异位点,ZJ1在第1、4、268位点处有变异,TS2在83位点处有变异,TS1在第112位点处有变异,ZQ4在169位点处有变异(表2)。从ITS2序列构建的邻接树(图1)可以看出,ZJ1单独为一类,其它广藿香聚为一大类,种内平均K2P距离为0.003,种内最大K2P距离为0.006,各样本间遗传距离很小。通过对比16个广藿香样品的psbA-trnH序列,结果显示所有样品的序列完全相同。综合以上两者说明不同产地广藿香的遗传背景有极大的相似性。