《表2 MG组较CON组表达显著降低的lncRNAs》

《表2 MG组较CON组表达显著降低的lncRNAs》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《模拟失重48h后血管内皮细胞长链非编码RNA的差异表达分析》


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通过对lncRNAs测序得到的原始数据进行清理,去除污染、低表达以及未比对成功的序列,共计获得两组样本间差异表达的lncRNAs 3153个。以差异倍数log2FC>2或<-2,P<0.05且FDR<0.05作为筛选标准,对CON组和MG组间差异表达的lncRNAs进行筛选。与CON组相比,MG组表达明显升高的lncRNAs有22个,表达明显降低的lncRNAs有15个(表1和表2)。利用测序结果中lncRNAs的RPKM值(expected number of Reads Per Kilobase of transcript sequence per Millions base pairs sequenced)进行层次聚类分析,根据lg(RPKM+1)数值的正负和大小绘制不同颜色和深浅的聚类热图,结果如图1所示。MG组与CON组相比,蓝色表示表达降低的lncRNAs,红色表示表达升高的lncRNAs。结果表明,回转模拟失重可引起HUVECs中部分lncRNAs的表达发生显著变化。