《表1 刺参13个SNP位点引物信息Tab.1 Information of 13 SNPs of A.japonicus》

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《刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析》


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自生长性状和抗病性状测定群体中各选取96个个体,采用(HRM)法(Reed et al,2007)进行SNP位点的PCR扩增和基因分型。10μl PCR反应体系:DNA模板1μl(50 ng/μl),4.5μl 2×ES Taq Master Mix,上下游引物各0.5μl(10μmol/L),3.5μl ddH2O;PCR反应程序:95℃预变性5 min;94℃变性30 s,退火30 s(退火温度见表1),72℃延伸30 s,共35个循环;最后72℃延伸7 min,4℃保存。用2%琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物。向PCR产物中加入染料LC Green 1.0μl,高低温内标的正负向引物各0.25μl,95℃变性5 min后降温至4℃保存,利用Light Scanner进行基因分型,基因分型用程序为以0.1℃/s的速度从56℃快速升温到97℃,并以1次/s的密度采集荧光信号,得到熔解曲线,采集结束后用Light Scanner配套软件对熔解曲线进行分析(Ting et al,2014)。