《表1 刺参13个SNP位点引物信息Tab.1 Information of 13 SNPs of A.japonicus》
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《刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析》
自生长性状和抗病性状测定群体中各选取96个个体,采用(HRM)法(Reed et al,2007)进行SNP位点的PCR扩增和基因分型。10μl PCR反应体系:DNA模板1μl(50 ng/μl),4.5μl 2×ES Taq Master Mix,上下游引物各0.5μl(10μmol/L),3.5μl ddH2O;PCR反应程序:95℃预变性5 min;94℃变性30 s,退火30 s(退火温度见表1),72℃延伸30 s,共35个循环;最后72℃延伸7 min,4℃保存。用2%琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物。向PCR产物中加入染料LC Green 1.0μl,高低温内标的正负向引物各0.25μl,95℃变性5 min后降温至4℃保存,利用Light Scanner进行基因分型,基因分型用程序为以0.1℃/s的速度从56℃快速升温到97℃,并以1次/s的密度采集荧光信号,得到熔解曲线,采集结束后用Light Scanner配套软件对熔解曲线进行分析(Ting et al,2014)。
图表编号 | XD0034464800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.01 |
作者 | 刘安然、廖梅杰、李彬、王印庚、荣小军、张正、范瑞用、陈贵平 |
绘制单位 | 上海海洋大学、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 |
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