《表2 10个多态性SNP位点的遗传参数Tab.2 Genetic diversity at 10 polymorphic SNPs of A.japonicus》

《表2 10个多态性SNP位点的遗传参数Tab.2 Genetic diversity at 10 polymorphic SNPs of A.japonicus》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析》


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注:P值表示偏离Hardy-Weinberg平衡情况,“*”表示显著偏离(P<0.05)Note:P:Deviation from Hardy-Weinberg equilibrium,*:Significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05)

利用13对引物对所检测的个体进行基因分型,利用Popgen32对所获得的所有个体的基因型统计分析。结果显示,3个位点(SNP6、SNP64和SNP91)在检测群体中没有多态性,为单态位点,其余10个位点为多态性位点。10个多态性位点的最小等位基因频率(MAF)介于0.016(SNP9)~0.332(SNP160)之间,平均值为0.173;各位点的观测杂合度(Ho)介于0.031(SNP113)~0.818(SNP9)之间,平均值为0.433;期望杂合度(He)介于0.031(SNP113)~0.834(SNP9)之间,平均值为0.402;多态信息含量(PIC)介于0.030(SNP113)~0.393(SNP160)之间,平均0.248(表2)。6个位点的观测杂合度(Ho)大于期望杂合度(He),固定指数(F)只有在SNP160位点是正值,其他均为负值;HardyWeinberg平衡分析结果显示,有6个SNP位点显著偏离平衡(P<0.05)。