《表2 10个多态性SNP位点的遗传参数Tab.2 Genetic diversity at 10 polymorphic SNPs of A.japonicus》
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《刺参(Apostichopus japonicus)重要经济性状相关SNP标记的验证分析》
注:P值表示偏离Hardy-Weinberg平衡情况,“*”表示显著偏离(P<0.05)Note:P:Deviation from Hardy-Weinberg equilibrium,*:Significant deviation from Hardy-Weinberg equilibrium (P<0.05)
利用13对引物对所检测的个体进行基因分型,利用Popgen32对所获得的所有个体的基因型统计分析。结果显示,3个位点(SNP6、SNP64和SNP91)在检测群体中没有多态性,为单态位点,其余10个位点为多态性位点。10个多态性位点的最小等位基因频率(MAF)介于0.016(SNP9)~0.332(SNP160)之间,平均值为0.173;各位点的观测杂合度(Ho)介于0.031(SNP113)~0.818(SNP9)之间,平均值为0.433;期望杂合度(He)介于0.031(SNP113)~0.834(SNP9)之间,平均值为0.402;多态信息含量(PIC)介于0.030(SNP113)~0.393(SNP160)之间,平均0.248(表2)。6个位点的观测杂合度(Ho)大于期望杂合度(He),固定指数(F)只有在SNP160位点是正值,其他均为负值;HardyWeinberg平衡分析结果显示,有6个SNP位点显著偏离平衡(P<0.05)。
图表编号 | XD0034464900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.01 |
作者 | 刘安然、廖梅杰、李彬、王印庚、荣小军、张正、范瑞用、陈贵平 |
绘制单位 | 上海海洋大学、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室 |
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