《表2 腹足纲贝类线粒体基因组相关信息》
在GenBank基因库中进行相似性分析得到17种腹足纲贝类动物线粒体基因组(表2)。使用DNAMAN软件分析泥东风螺与17种腹足纲动物线粒体基因组全长及线粒体上12S RNA、16S RNA、COXⅠ、COXⅡ、COXⅢ、和Cytb基因相似性(表3)。研究结果表明,18种腹足纲动物线粒体基因组间相似性为70.1%~92.9%;泥东风螺与其他贝类间的相似性为74.1%~92.9%,泥东风螺与方斑东风螺相似性最高,达92.9%;除与似鲍罗螺(Concholepas concholepas)的COXⅢ基因相似性为50.4%外,泥东风螺线粒体上的COXⅠ、COXⅡ、COXⅢ、12SRNA、16SRNA、Cytb基因与其他17个物种对应基因的相似性为70.07%~99.00%;将泥东风螺与其他贝类线粒体基因组全长及各基因相似性作折线图(图2)可知,12SRNA和16SRNA相似性折线与线粒体基因组全长相似性折线变化相似。经12SRNA和16SRNA基因保守性分析发现,物种之间12SRNA的391~491bp区域为高度变异区,物种之间16SRNA的1~106bp和361~481bp区域为高度变异区,而物种之间16SRNA的1191~1317bp区域为高度保守区;物种之间COXⅢ相似性与线粒体基因全长相似性表现相当,而COXⅠ、COXⅡ基因相似性更高,这两个基因的物种间相似性均值分别为82.96%和83.00%。
图表编号 | XD0028810600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.01 |
作者 | 熊钢、周先文、王晓清、巫旗生、康骊、秦溱、曾志南 |
绘制单位 | 湖南生物机电职业技术学院、水产高效健康生产湖南省协同创新中心、湖南农业大学、水产高效健康生产湖南省协同创新中心、湖南农业大学、水产高效健康生产湖南省协同创新中心、湖南农业大学、福建省水产研究所、湖南生物机电职业技术学院、水产高效健康生产湖南省协同创新中心、湖南农业大学、福建省水产研究所 |
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