《表3 3种桑黄特征序列信息Tab.3 Target sequence information of the three‘Sang Huang’strains》

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《基于DNA条形码的桑黄真菌分子鉴定》


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以ITS和NL序列扩增获得的PCR产物测序后,提交GenBank,其序列信息见表3。利用MEGA 7.0软件,以GenBank数据库中桑黄类真菌ITS和NL序列信息为参照、NJ法和1000次检验,分别构建基于ITS和NL序列的系统发育树(图3和图4)。基于ITS序列的系统发育分析显示,1713菌株与桑黄纤孔菌(I.sanghuang)相似性最高,为99%,遗传距离为0.003;HS和1714菌株与鲍氏针层孔菌(I.baumii)相似性最高,分别为100%和99%,遗传距离分别为0.003和0.000。基于NL序列的系统发育分析也显示了相同的结果,1713菌株与桑黄纤孔菌(I.sanghuang)聚在一类,相似性为99%,遗传距离为0.009;HS和1714菌株与鲍氏针层孔菌(I.baumii)聚在一类,相似性均为99%,遗传距离分别为0.012和0.009。基于ITS和NL序列联合矩阵的系统发育树见图5。1713菌株与桑黄纤孔菌(I.sanghuang)聚在一类,相似性为100%,遗传距离为0.006;HS和1714菌株与鲍氏针层孔菌(I.baumii)聚在一类,相似性均为99%,遗传距离分别为0.002和0.003。