《表1 ApxⅠA蛋白抗原肽预测》

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《猪胸膜肺炎放线杆菌ApxⅠA基因克隆与生物信息学分析》

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采用DNAman进行分析，发现ApxⅠA蛋白有13个抗原肽片段，如表1所示，其中128、129和130位点的抗原性指数较高。对ApxⅠA蛋白进行信号肽预测，通过综合剪切点分值（Y）的最大值来预测的信号肽的剪切位点，通过信号肽分值（S）平均值来判断蛋白是否为分泌蛋白，如果S的平均值大于0.5，那么该蛋白被推测为分泌蛋白，并且有信号肽的存在。基于神经网络算法的结果（图4）表明，该蛋白无信号肽序列，整个编码序列可完全用于原核表达。