《表3 SNP位点在染色体中的分布密度Tab.3 The average SNP density and loci in 11chromosomes in W1-1 and PI186490》

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《CAPS标记开发及果实相关性状QTL分析》

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花园母本和PI 186490进行全基因组重测序后，获得的高质量读段数目分别为92 838 313和91 970 999，其中比对到参考基因组的分别为91 439 063（约为总的98.49%），90 110 237（约为总的97.98%），分别覆盖了参考基因组的90%和88%，平均覆盖深度为26×和25×。经SNP位点挖掘与分析，结果表明1到11号染色体共检测出751 532个SNP位点。SNP位点在各染色体的分布密度情况如表3及图2所示。两个亲本材料之间SNP位点的密度范围是1 693~3 048。4号染色体SNP位点最少，11号染色体SNP位点最多。