《表9 前5个通路的详细信息》

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《用于样本聚类和网络分析的整合鲁棒结构化NMF模型》


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为了进一步发现网络中的基因的生物功能,利用Cytoscape对这些基因进行了京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析并构建了功能分组网络.富集程度最高的前5个通路的详细信息如表9所示.功能分组网络可以根据相关基因的相似性来展示术语之间的关系[34],如图6所示.其中,红色标签的节点代表基因,其他颜色标签对应的节点代表的是通路.基因和通路之间的连线代表二者相关.不难发现,网络中有许多基因与多个通路相关并起着桥梁的作用.与多个通路有关的基因可能在生物体的生长过程中起重要作用,应进一步进行探究.在分组网络中,通路节点的大小代表基因在该通路的富集程度,颜色代表该通路隶属于哪一个功能组.具有相同功能的通路,其对应的节点被赋予了相同的颜色[34].其中,彩色标签的通路是其所属功能组中富集程度最显著的通路,组内其他的通路标签颜色为灰色.