《表1 CRF01＿AE毒株传播簇特征性氨基酸分析》

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《广东省江门市HIV-1亚型及流行毒株gag基因特征分析》

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对CRF01＿AE毒株在本地区形成的主要的两种传播簇进行特征性氨基酸分析，以传播簇I为背景序列，以传播簇Ⅱ为分析序列，分析检验阈值为0.1，两簇的特征性氨基酸的出现频率均有不同程度的差异，其中背景序列中的第215位（HXB2）氨基酸为缬氨酸（V），而在分析序列中该位点被苏氨酸（T）取代（100%），共发现11个位点的特征性氨基酸组成在两个传播簇中的分布存在显著差异，分别形成了不同的氨基酸组成模式（表1）。