《表1 诺如病毒扩增引物:义乌市3起学校诺如病毒急性胃肠炎疫情的病原分子流行病学特征》
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《义乌市3起学校诺如病毒急性胃肠炎疫情的病原分子流行病学特征》
取病毒RNA核酸提取液5μL,用诺如病毒GⅠ/GⅡ型real-time RT-PCR检测试剂盒定性检测,检测条件及GⅠ、GⅡ型结果判断参照试剂盒说明书。分别采用引物G1SKF/G1SKR和G2SKF/G2SKR扩增诺如病毒核酸检测阳性标本的部分序列,引物见参考文献[4],目的片段为330 bp和344 bp,见表1。反应条件:42℃反转录3 min;95℃预变性2 min;95℃变性30 s、55℃退火30 s、72℃延伸30 s,40个循环;72℃延伸10 min。将有阳性条带的PCR扩增产物送至生工生物工程(上海)股份有限公司测序。利用Meg Align软件进行序列对比和同源性分析,利用Mega 7.0软件构建系统进化树,结合诺如病毒基因在线分型工具(http://www.rivm.nl/mpf/norovirus/typingtool) BLAST比对结果,综合判定病毒基因型别[5]。
图表编号 | XD00218735200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.03.10 |
作者 | 翁正军、陈波、朱婧、陈莫娇 |
绘制单位 | 义乌市疾病预防控制中心办公室、义乌市疾病预防控制中心办公室、义乌市疾病预防控制中心办公室、义乌市疾病预防控制中心办公室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |