《表3 杨梅10个品种与参考基因组之间的SNP开发与检测》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《‘永泰’杨梅亲本鉴定及其单核苷酸多态性遗传变异分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

通过对杨梅各品种（材料）的SNP与参考基因组[27]进行比对，汇总所有差异的SNP变异位点，并开发出核心SNP标记。SNP位点变异分转换和颠换2种类型：同类型碱基之间突变称为转换，如嘌呤与嘌呤、嘧啶与嘧啶之间的变异；不同类型碱基之间的突变称为颠换，如嘌呤与嘧啶之间的变异。10个杨梅品种（材料）的SNP转换的变异数量均显著大于颠换数量，且转换与颠换比均大于1（表3）。这说明SNP转换比颠换变异更容易发生。杨梅同源染色体上的某一SNP位点均为同一种碱基，则该SNP位点称为纯合SNP位点；若包含不同类型的碱基，则该SNP位点称为杂合SNP位点。10个杨梅品种杂合SNP位点数均显著大于纯合SNP位点数（表3）。这说明各个品种的SNP杂合程度较高，与参考基因组的SNP位点对比变异显著。