《表1 解旋酶二级结构预测》

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《非洲猪瘟病毒解旋酶结构与功能研究进展》


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在NCBI数据库下载ASFV Georgia 2007株的QP509L (YP-009704074)氨基酸序列,通过SnapGene4软件分析,编码氨基酸长度为509 aa,预测分子质量为58.1 ku。在线网址https://web.expasy.org/protparam/提交氨基酸序列后,对QP509L的理化性质进行预测与分析。结果表明,其等电点值为9.28,根据其不稳定系数(40.24)、脂肪系数(99.21)、总平均亲水性(-0.154 0),认为该蛋白是亲水性蛋白且不稳定。把QP509L氨基酸序列提交到在线工具进行二级结构分析,结果表明,QP509L的α螺旋(39.88%)和无规则卷曲(34.18%)在二级结构中所占比例较多(表1,图3A),将氨基酸序列提交到在线工具Swiss-Model分析得到三维结构,根据同源建模的原理,获得了QP509L的三级预测结构(图3B、C、D)。