《表1 解旋酶二级结构预测》
在NCBI数据库下载ASFV Georgia 2007株的QP509L (YP-009704074)氨基酸序列,通过SnapGene4软件分析,编码氨基酸长度为509 aa,预测分子质量为58.1 ku。在线网址https://web.expasy.org/protparam/提交氨基酸序列后,对QP509L的理化性质进行预测与分析。结果表明,其等电点值为9.28,根据其不稳定系数(40.24)、脂肪系数(99.21)、总平均亲水性(-0.154 0),认为该蛋白是亲水性蛋白且不稳定。把QP509L氨基酸序列提交到在线工具进行二级结构分析,结果表明,QP509L的α螺旋(39.88%)和无规则卷曲(34.18%)在二级结构中所占比例较多(表1,图3A),将氨基酸序列提交到在线工具Swiss-Model分析得到三维结构,根据同源建模的原理,获得了QP509L的三级预测结构(图3B、C、D)。
图表编号 | XD00216415500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.02.20 |
作者 | 张婷、申超超、杨博、张大俊、侯景、史喜绢、崔卉梅、张克山、郑海学、刘湘涛 |
绘制单位 | 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室国家口蹄疫参考实验室、中国农业科学院兰州 |
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