《表1 不同处理二化螟试虫中肠细菌群落多样性指数》

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《氯虫苯甲酰胺胁迫下二化螟中肠细菌类微生物的多样性》

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样本名中数字100、200、400分别表示氯虫苯甲酰胺处理浓度100，200和400 mg/μL，CK为二甲基亚砜处理，24h、48h和72h表示处理时间；括号内数字表示该指数测试的最高值和最低值。

Illumina PE250测序：中肠细菌类微生物DNA检测质量稀释后作为模板，根据测序区域的选择，使用带Barcode的特异引物，PCR扩增（表1）之后割胶回收产物。回收DNA片段的一端与引物碱基互补，固定在芯片上；另一端随机与附近的另外一个引物互补，形成“桥（bridge）”产生DNA簇；DNA扩增子线性化成为单链。加入改造过的DNA聚合酶和带有4种荧光标记的d NTP，每次循环只合成一个碱基；用激光扫描反应板表面，读取每条模板序列第一轮反应所聚合上去的核苷酸种类；将“荧光基团”和“终止基团”化学切割，恢复3'端黏性，继续聚合第二个核苷酸；统计每轮收集到的荧光信号结果，获知模板DNA片段的序列。Illumina PE250测序得到的双末端读长（PE reads）首先进行拼接、质控和过滤，区分样本后进行OTU聚类分析和物种分类学分析，对优化序列提取非重复序列，降低分析中间过程冗余计算量，去除没有重复的单序列，按照97%相似性对非重复序列（不含单序列）进行OTU聚类，基于OTU聚类分析结果，可以对OTU进行多种多样性指数分析，以及对测序深度的检测；基于分类学信息，可以在各个分类水平上进行群落结构的统计分析。在上述分析的基础上，可以进行一系列群落结构和系统发育等深入的统计学和可视化分析。